この人も同じ現象で同じ状態だったので、参考にしてみる。
ぼくもプラグインの修正で動かしたものの
修復しきれなかったので、困っている。
どうやら元からあるサムネイルを除去しないといけないみたいだ。
この記事だと400ほどの画像を削除することで解決したみたいですが、
8000記事ほどあるぼくサイトでは、、ちょっと厳しい。
WordPress 3.4 日本語版にアップデートしたらアイキャッチ画像がほとんど表示されなくなったのを修復する | ハヤクユケ
試してみようと思うのは、
WordPressのアイキャッチ画像を一括で復旧する方法 | http://highhigherhighest.com/
http://highhigherhighest.com/2012/04/16/WordPress-eyecatch-repair-auto-post-thumbnail/
こちらの方法を使ってphpmyadminから画像を削除。